На территории зоопарка расположены закрытые и открытые павильоны. В закрытых, в основном, содержатся хищники, хотя они ничем не напоминают те тесные клетки, в которых содержатся животные в других зоопарках. Условия в них, практически те же, что и в дикой природе. В Пражском зоопарке возведены три крупных закрытых павильона:

Исполинские черепахи

Фламинго

К сожалению, не настолько розовые как хотелось бы

Гавияль индийский

Принадлежит к самым большим и самым ужасным видам крокодилов. Его существование тесно связано с водной средой, а челюсти приспособлены для ловли рыб. Живут группами, которые обычно состоят из взрослого самца и нескольких самок

Капибара

Это самый большой грызун на свете. Отлично плавает и ныряет, при нырянии остается под водой на 5 минут. В воде находит убежище от жары и от большинства хищников. В воде также и спаривается, но детенышей рожает на суше

Филин рыбный малайский

Ноги у него приспособлены к хватанию рыб - ступни и пальцы покрыты роговыми пластинками, которые предотвращают расцепление добычи. Ловят или при низком полете над водой или во время прогулок в мелкой воде, где собирают крабов или моллюсков

Очковая сова

Носит на себе контрастный рисунок, служащий для маскировки. У птенцов противоположная по контрасту окраска. Охотится преимущественно ночью, сидя на ветке и высматривая добычу